安全問題是管理系統的命脈，對于汽車號牌自動識別系統來說，安全尤為重要，由于汽車號牌是汽車最為明顯的標識，現實中人們都是通過號牌識別違、章車輛、肇事車輛，坪西停車場車牌識別系統電話-F款T3版本相機車牌識別軟件因此系統必須保證標簽中的號牌數據不能被隨意讀取甚至篡改。但標簽本身的安全又很薄弱，因此必須采用合理有效的方法才能保證系統的安全。

對于通信安全和閱讀器的安全問題，藍西特人們研究得非常多，坪西停車場車牌識別系統電話-F款T3版本相機車牌識別軟件而且也提出很多行之有效的方法，這些方法包括：采用安全的通信協議或專有的通信協議，如Hash2Lock協議、Hash鏈協議、基于雜湊的ID變化協議、詢問。響應認證協議、再次加密機制等等。使用探測器探測其他RFID閱讀器的存在，并發送干擾信號，以防標簽上的數據被暴露;為標簽編程，使其只可能與已授權的RFID閱讀器通信;對標簽和閱讀器采用更強的加密及安全功能;此外還提出了Kill標簽、法拉第網罩、智能標簽、阻止標簽等方法。這些方法均很成熟，并各有自己的特色和不足，必須針對不同的應用靈活選擇和組合。