鹽酸小檗堿具有治療胃腸炎、細菌性痢疾等腸道感染、眼結膜炎、化膿性中耳炎等有效。近來還發現本品有阻斷 α-受體，抗心律失常作用。

鹽酸小檗堿各項參數如下：

植物來源：蕓香科植物黃檗的干燥樹皮  
別名：黃連素、小蘗堿、小檗鹼、鹽酸黃連素
英文名：Berberine
分子式：C20H19ClNO4
分子量：372.8216
CAS號：633-65-8
檢測方式：滴定法
規格：≥98%
性狀：淺黃色結晶性粉末；氣微，味極苦。
鹽酸小檗堿藥理：藥效學：抗菌譜廣，體外對多種革蘭陽性及陰性菌均具抑菌作用，其中對溶血性鏈球菌、金葡菌、霍亂弧菌。腦膜炎球菌、志賀痢疾桿菌、傷寒桿菌、白喉桿菌等有較強的抑制作用，低濃度時抑菌，高濃度時殺菌。對流感病毒、阿米巴原蟲、鉤端螺旋體、某些皮膚真菌也有一定抑制作用。體外實驗證實黃連素能增強白細胞及肝網狀內皮系統的吞噬能力。痢疾桿菌、溶血性鏈球菌、金葡菌等極易對本品產生耐藥性。本品與青霉素、鏈霉素等并無交叉耐藥性。
藥動學：口服吸收差。注射后迅速進入各器官與組織中，血藥濃度維持不久。肌注后的血藥濃度低于最低抑菌濃度。藥物分布廣，以心、骨、肺、肝中為多。在組織中滯留的時間短暫，24小時后僅剩微量，絕大部分藥物在體內代謝清除，48小時內以原形排出僅占給藥量的 5%以下。
本品能使菌體表面的菌毛數量減少，使細菌不能附著在人體細胞上，而起治療作用。本品對螺旋桿菌也有作用，而能使胃炎、胃及十二指腸潰瘍減輕。