文冠果的莖中含有2α,3β雙氫楊梅槲皮素（2α,3β-dihydromyricetin）、2α,3β-雙氫槲皮素（2α,3β-dihydroguercetin）、2β,3β-表兒茶精（2β,3β-epicatechin）和2β,3β-表沒食子兒茶精（2β,3β-epigallocatechin）。1998年，白玉霞等從文冠木中提取了總黃酮。1999年，張文霞等又從文冠木的醇提取物中進一步分離得到一種新的化合物，命名為文冠木素（Xanthocerin），化學名稱為7,9-二羥基-4-甲基-2,4a,10,10a-四氫-吡喃并[3,2-b][1]苯并吡喃-2-酮（7,9-dihydroxy-4-methyl-2,4α,10,10α-tetrahydro-pynano[3,2-b][1]benzopyran-2-one），并首次從文冠果屬植物中提取得到七葉內酯和2,5-二甲基對苯醌。1981年，王紅斗等報道了文冠果種仁含油60%，并用氣液色譜分析出其中含有14種脂肪酸，其中6種為不飽和脂肪酸，碳鏈長度C16～C18，同普通柴油的碳鏈長度（C15～C19）極接近。